《徐霞客游記》中記錄了不少動植物的名稱，其中有關中草藥的知識，也值得今天的讀者矚目。

《粵西游日記一》崇禎十年（1637）五月初二日記有“種圃灌園者而聚廬焉”一句，其后小字注：“種金系草，為吃煙藥者。”筆者所見注家皆未出注，先出的白話本譯為：“種植金系草，是吃煙人的藥。”后出者譯為：“種金系草，是吃煙人的藥。”兩者大同小異。所謂“金系草”，并不見于諸多藥典，當即“金絲草”之形訛，“系”“絲”，顯然因字形相近而致誤。

所謂“金絲草”，或稱落蘇、黃毛草、筆子草、貓尾草等，不一而足。它屬于多年生草本植物，葉條狀披針形，花乳白色，莖直立，叢生。全草入藥，有清熱、解毒、利尿等功用。明李時珍《本草綱目》卷一三《草二·金絲草》有云：“氣味：苦寒無毒。主治：吐血、咳血、衄血、下血、血崩、瘴氣，解諸藥毒，療癰疽疔腫惡瘡，涼血散熱。”至于所謂“煙藥”，更與“吃煙”毫無關聯，乃是古代一種傳統的炮制中藥制劑法，即將藥物置于燒紅的鐵片上，通過瓷碗吸附其飛散的藥粉，冷卻后收集。據說，此過程需重復五次以增強藥效。煙藥主要用于治療瘰疬、五痔、癭瘤瘡根惡腫等疾病，其主要成分包括石黃、空青、桂心和干姜等，上述“金絲草”當是所制煙藥的主要成分之一。明李時珍《本草綱目》卷一三《草二·金絲草》后錄“附方”，有治療“婦人血崩”“癰疽疔腫”“天蛇頭毒”等疾病者，皆以“金絲草”為方劑之首味藥選，其功用可一目了然。

《粵西游日記二》崇禎十年（1637）六月十六日記：“另覓益元散，并藥劑令顧仆傳致之，諭以醫意，先服益元，隨煎劑以服。”所謂“益元散”，就屬于中醫傳統經典方劑之一，源自《黃帝素問宣明論方》，其方即以滑石、甘草、朱砂等配伍而成，具有清暑利濕、益氣養陰的功效，適用于暑熱傷津、體倦口渴、小便短赤等癥。在“萬里遐征”的廣西之行中，霞客為方外之友靜聞和尚治病，煞費心機，為之求醫問藥乃至尋求民間偏方，堪稱不遺余力。

《粵西游日記二》崇禎十年（1637）六月二十八日記：“此中豬腰子、山豆根俱出羅城。”七月十七日記又云：“既而復從南門入抵北門，市土藥于朱醫士，得山豆根、豬腰子、天竺黃、水蘿葡、兔金藤諸藥各少許。”《游記》前后兩次提及“豬腰子”，并且與山豆根、水蘿葡等草藥相提并論，一望可知就是一種植物類草藥，而絕非豬的腎臟。《明一統志》卷八三《廣西布政司·柳州府·土產》著錄：“豬腰子，木生子，形如豬腎，能解毒藥。”明李時珍《本草綱目》卷三五《木二·豬腰子》著錄：“時珍曰：豬腰子，生柳州，蔓生結莢，內子大若豬之內腎，狀酷似之。長三四寸，色紫而肉堅。彼人以充土宜，饋送中土。”據說，研細酒服一二錢并涂之，可治一切瘡毒。《徐霞客游記》的百科全書性質于此可見一斑。